"Christian Kelstrup" <ckelstrup@get2netDOTdk> skrev i en meddelelse
news:Xns9196E2CF0F69Ecdk@193.88.15.213...
> Tommy Nasser wrote:
>
> [...]
> >Vil du dermed sige at en binding mellem et C-atom og et andet C-atom
> >er en hydrofob
> >binding?
>
> Tja...jeg tror jeg forvirrede situationen ved at skrive bindinger. Jeg
> mente interaktioner. Det har ikke noget med en kovalent binding at gøre
> (som jeg tror du tænker på).
>
> >Dette er jo en binding mellem to atomer hvorimellem forskellen i
> >elektronegativitet
> >er 0...
> >
> >I virkeligheden er der vel slet ikke noget der hedder en "hydrofob
> >binding", men nærmere hydrofobe interaktioner, da der jo ikke er
> >tale om en binding i kalssisk forstand.
> >(delte elektroner)
>
> Nu er delte elektroner jo ikke den eneste binding der findes, men du
> har fuldstændig ret. Jeg burde ikke kalde det hydrofobe *bindinger*.
> Jeg burde kalde dem interaktioner som du skriver, men nu gik
> spørgsmålet på bindinger - så jeg valgte samme ordvalg for ikke at lave
> en let forklaring og ikke forvirre mere end højst nødvendigt - det
> lykkedes så ikke, tværtimod. :(
>
> Jeg forsøger en gang mere med de hydrofobe interaktioner
>
> Hydrofobe interaktioner er næsten udelukkende relevante i væskefasen da
> gasfasen betyder at der er meget stor afstand mellem molekylerne og
> derfor betyder de hydrofobe interaktionskræfter intet[1]. I solid fasen
> er der ikke ret meget mobilitet af molekylerne => hydrofobe
> interaktioner betyder intet[1].
>
> Grundlæggende har man, at hvis man har nogle molekyler, hvor
> elektronfordelingen ikke inducerer en dipol (dvs. de er upolære - kan
> afgøres ud fra de enkelte atomers elektronegativitet og den rumlige
> struktur af stoffet), vil disse molekyler have en tendens til at søge
> sammen, når de bliver udsat for et hydrofilt stof (fx vand, eddike,
> sprit). Større molekyler som fx enzymer og fedtsyrer kan have mere
> komplicerede kombinerede hydrofobe og hydrofile interaktioner - både
> mellem flere molekyler og internt i det samme molekyle.
>
> Håber det var et bedre bud på en forklaring :)
>
> Christian
>
> [1] forbehold for (IMHO her irrelevante) undtagelser.
Ehm.......tak for forklaringen :)
Men jeg ved ikke rigtigt om det passer ind i det som jeg skal forklare. I
dette tilfælde er det en hydrofobbinding (interaktion) mellem sidegrupper i
et proteins tertiære struktur *håber du kender til det !* På den figur jeg
har er det 2 benzenringe der er "koblet" sammen.
Jeg kan jo altid håbe at jeg ikke bliver spurgt om det til eksamen imorgen
:o|
MVH
/Ras ;)